ماموریت :
- مشارکت در فرآیند تصمیم سازی‌ها و سیاستگذاری‌های کلان صنعت آب و آبفا
- انجام کلیه فرآیندهای عملیاتی طرح‌های تحقیقاتی کلان در صنعت آب و آبفا
-بررسی و شناسایی نیازهای پژوهشی (نیازسنجی تحقیقات) در کلیه زمینه‌های مرتبط با صنعت آب و آبفا (تعریف طرح‌های ملی) و معضلات و مشکلات مبتلا به شرکتها (تعریف طرح‌های خاص منطقه‌ای)
- نهادینه کردن فرهنگ پژوهش و نوآوری در صنعت آب و آبفا
- توانمند سازی پژوهشگران و نیروهای متخصص از طریق انجام پروژه های تحقیقاتی و پایان‌نامه‌های دانشجوئی تحصیلات تکمیلی.
-ایجاد بسترهای مناسب به منظور تجاری سازی دستاوردهای پژوهشی صنعت آب و آبفا
- ایجاد زمینه مناسب برای ارتقاء سطح کیفی فعالیت‌های پژوهشی در جهت انجام پژوهش‌های بنیادی، کاربردی و توسعه‌ای
-انتقال تجارب سایر کشورها در زمینه‌های مرتبط با صنعت آب و آبفا به داخل و بومی‌سازی آنها
-ایجاد نظام اطلاع رسانی تحقیقات (بانک اطلاعات تحقیقات) صنعت آب و آبفا
- ایجاد شرایط مبادله و گردش اطلاعات پژوهشی ( با تأکید بر گردش مجازی)
- ایجاد نظام ارزیابی دقیق اثر بخشی نتایج پژوهشی حاصل از انجام تحقیقات (اجرای یافته‌های پژوهشی)
- انتقال دستاوردهای حاصل از انجام تحقیقات به مراکز علمی- پژوهشی و صنایع مرتبط، از طریق انتشار نتایج پروژه‌های تحقیقاتی انجام شده
چشم انداز :
-دستیابی شرکتهای مؤسس پژوهشکده (آب منطقه‌ای، آبفا و آبفار) به جایگاه مناسب علوم و فناوری در سطح ملی از طریق نهادینه شدن پژوهش در کليه ابعاد و کسب رتبه برتر در میان سایر شرکتهای مشابه در سطح کشور از حیث تحقیقات.
-افزایش سطح مهارتهای علمی و فنی کارشناسان شرکتهای عضو پژوهشکده
- ارتقاء زمینه تحقیقات صنعت آب و آبفا و ایجاد بستری مناسب جهت انسجام و هماهنگی پروژه‌های کاربردی شرکتها و پرهیز از انجام پروژه‌های تکراری و موازی در سطح استان و کشور